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HISAT2
ダウンロード
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使い方
hisat2-buildでレファレンスのインデックスを作る
hisat2-build reference_genome.fasta reference_genome.fasta
・paired endの場合
hisat2 [options] -x reference_genome.fasta -1 read_R1.fastq -2 read_R2.fastq > map.sam
#オプション
#p:コア数
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