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Bowtie

インストール方法


こちらでダウンロードします。

使い方

Preparation for mapping
  bowtie2-build reference_genome.fasta reference_genome.fasta

Mapping
 bowtie2 [options] -x reference_genome.fasta -1 data_R1.fasta -2 data_R2.fasta -S output.sam
option:
-ｐ：コア数


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