プライマー配列
・FAM-labeled M13(-21) universal primer:
FAM-TGTAAAACGACGGCCAGT
FAM以外に別の蛍光色素を付加することで,マルチプレックスも可能になる。
・A fusion of a leading M13(-21) universal sequence with the originally
published primer sequence:
TGTAAAACGACGGCCAGTAGAGACTAGACAAGTTGCA
予測されたプライマー配列にM13(-21)を付加する。
PCR組成
2.0ul 5xBuffer
0.8ul dNTPs
0.5ul 0.1nM Forward primer
2.0ul 0.1nM FAM-labbedled primer
2.0ul 0.1nM Reverse primer
1.0ul Template DNA(0.1ng/nl)
0.2ul GXL polymerase
1.5ul water
---
10.0ul Total
(注意)
taq系のポリメラーゼを使用すると,ピークが2つに分かれてしまう可能性がある。
そうすると,解析しにくい....
PCR反応条件
94°C: 5 min
94°C: 30 s |
56°C: 45 s | 30サイクル
72°C: 45 s |
94°C: 30 s |
53°C: 45 s | 8サイクル
72°C: 45 s |
72°C: 10 min
参考文献
Markus Schuelke, An economic method for the fluorescent labeling of PCR
fragments.
NATURE BIOTECHNOLOGY, 2000, 18: 233-234. [
PDF]