氏名

半田佳宏

@香嵐渓(2013/11/24)

• 略歴
• 所属学会
• 論文
• 口頭発表
• ポスター発表
• 研究者登録サイト
• 受賞歴

過去に所属していた学会

　学生時代（専門：分子生物学）
　　・日本分子生物学会 (2008年 -- 2011年)

　ポスドク時代（専門：植物共生）
　　・日本植物生理学会 (2011年 -- 2015年)
　　・日本植物学会 (2011年 -- 2015年)
　　・日本菌学会 (2015年度)
　　・植物微生物研究会 (2011年 -- 2015年)
　　・菌根研究会 (2015年度）
　
　会社員・取締役時代（専門：環境DNA、ジェノタイピング技術）
　　・日本昆虫学会 (2018年度)

投稿論文

１．Handa Y, Hikawa Y, Tochio N, Kogure H, Inoue M, Koshiba S, Güntert P, Inoue Y, Kigawa T,
　　Yokoyama S, Nameki N.
　　Solution structure of the catalytic domain of the mitochondrial protein ICT1 that is essential for cell
　　vitality.
　　J Mol Biol. 2010, 404(2):260-73. [PubMed]
２．Handa Y, Inaho N, Nameki N.
　　YaeJ is a novel ribosome-associated protein in Escherichia coli that can hydrolyze peptidyl-tRNA on
　　stalled ribosomes.
　　Nucleic Acids Res. 2011, 39(5):1739-48. [PubMed] Featured Articles
３．Tisserant E, Malbreil M, Kuo A, Kohler A, Symeonidi A, Balestrini R, Charron P, Duensing N, Frei Dit Frey
　　N, Gianinazzi-Pearson V, Gilbert LB, Handa Y, Herr JR, Hijri M, Koul R, Kawaguchi M, Krajinski F, Lammers
　　PJ, Masclaux FG, Murat C, Morin E, Ndikumana S, Pagni M, Petitpierre D, Requena N, Rosikiewicz P, RileyR
　　Saito K, San Clemente H, Shapiro H, van Tuinen D, Bécard G, Bonfante P, Paszkowski U, Shachar-Hill YY,
　　Tuskan GA, Young PW, Sanders IR, Henrissat B, Rensing SA, Grigoriev IV, Corradi N, Roux C, Martin F
　　Genome of an arbuscular mycorrhizal fungus provides insight into the oldest plant symbiosis.
　　Proc Natl Acad Sci U S A. 2013, 110(50): 20117-22. [PubMed]
4． Kogure H, Handa Y, Nagata M, Kanai N, Güntert P, Kubota K, Nameki N.
　　Identification of residues required for stalled-ribosome rescue in the codon-independent release factor
　　YaeJ.
　　Nucleic Acids Res. 2014, 42(5): 3152-63. [PubMed]
5.　Kikuchi Y, Hijikata N, Yokoyama K, Ohtomo R, Handa Y, Kawaguchi M, Saito K, Ezawa T.
　　Polyphosphate accumulation is driven by transcriptome alterations that lead to near-synchronous and
　　near-equivalent uptake of inorganic cations in an arbuscular mycorrhizal fungus.
　　New Phytol. 2014, 204(3):638-49 [Pubmed]
6.　Chungopast S, Hirakawa H, Sato S, Handa Y, Saito K, Kawaguchi M, Tajima S, Nomura M.
　　Transcriptomic profiles of nodule senescence in Lotus japonicus and Mesorhizobium loti symbiosis.
　　Plant Biotechnology 2014, (in Press) [J-stage]
7.　Takeda N, Handa Y, Tsuzuki S, Kojima M, Sakakibara H, Kawaguchi M.
　　Gibberellins Interfere with Symbiosis Signaling and Gene Expression, and Alter Colonization by
　　Arbuscular Mycorrhizal Fungi in Lotus japonicus.
　　Plant Physiol. 2014, 167(2):545-57 [Pubmed]
8.　Handa Y, Nishide H, Takeda N, Suzuki Y, Kawaguchi M, Saito K.
　　RNA-seq Transcriptional Profiling of an Arbuscular Mycorrhiza Provides Insights into Regulated and
　　Coordinated Gene Expression in Lotus japonicus and Rhizophagus irregularis.
　　Plant Cell Physiol. 2015, 56(8):1490-511 [Pubmed]
9.　Takeda N, Handa Y, Tsuzuki S, Kojima M, Sakakibara H, Kawaguchi M.
　　Gibberellin regulates infection and colonization of host roots by arbuscular mycorrhizal fungi.
　　Plant Signal Behav. 2015, 10(6):e1028706 [Pubmed]
10. Tsuzuki S, Handa Y, Takeda N, Kawaguchi M.
　　Strigolactone-induced putative secreted protein 1 is required for the establishment of symbiosis by the
　　arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis.
　　Mol Plant Microbe Interact. 2016, 29(4):277-86. [Pubmed]
11. Kikuchi Y, Hijikata N, Yokoyama K, Ohtomo R, Handa Y, Kawaguchi M, Saito K, Masuta C, Ezawa T.
　　Aquaporin-mediated long-distance polyphosphate translocation directed towards the host in arbuscular
　　mycorrhizal symbiosis: application of virus-induced gene silencing.
　　New Phytol. 2016, 211(4):1202-8. [Pubmed] F1000Prime
12. Nishida H, Handa Y, Tanaka S, Suzaki T, Kawaguchi M.
　　Expression of the CLE-RS3 gene suppresses root nodulation in Lotus japonicus.
　　Journal of Plant Research. 2016, 129(5):909-19 [Pubmed]
13. Igarashi Y, Aihara H, Handa Y, Katsumata H, Fujii M, Nakano K, Hirao T.
　　Development and evaluation of microsatellite makers for the critically endangered birch Betula 　　
　　chichibuensis (Betulaceae).
　　Applications in Plant Sciences. 2017, 5(5): 1700016 [Pubmed]
14. Yamamoto M, Handa Y, Aihara H, Setoguchi H.
　　Development and characterization of 24 microsatellites in primula tosaensis, an endangered primrose,
　　using MiSeq.
　　Plant Species Biology 2017, 5(5) [Pubmed]
15. Yamamoto M, Handa Y, Aihara H, Setoguchi H.
　　Development and characterization of 43 microsatellite markers for the critically endangered primrose
　　Primula reinii using MiSeq sequencing.
　　Plant Diversity 2017 14;40(1) [Pubmed]
16. Nishida H, Tanaka S, Handa Y, Sakamoto Y, Matsunaga S, Betsuyaku S, Miura K, Soyano T,
　　Kawaguchi M, Suzaki T.
　　A NIN-LIKE PROTEIN mediates nitrate-induced control of root nodule symbiosis in Lotus japonicus.
　　Nature Communications 2018, 5; 9(1) DOI: 10.1038/s41467-018-02831-x [Pubmed]
17. Ikenaga M, Katsuragi S, Handa Y, Katsumata H, Chishaki N, Kawauchi T, Sakia M.
　　Improvement of bacterial primers to enhance the selective SSU rRNA genes amplification of
　　plant-associated bacteria by applying LNA oligonucleotide - PCR clamping technique.
　　Microbes and Environments 2018 33(3):340-344 [Pubmed]
18. Suzaki T, Takeda N, Nishida H, Hoshino M, Ito M, Misawa F, Handa Y, Miura K and Kawaguchi M.
　　LACK OF SYMBIONT ACCOMMODATION controls intracellular symbiont accommodation in root nodule
　　and arbuscular mycorrhizal symbiosis in Lotus japonicus.
　　PLOS Genet. 2019 15: e1007865. [Pubmed]
19. Kameoka H, Tsutsui I, Saito K, Kikuchi Y, Handa Y, Yamaguchi K, Shigenobu S, Ezawa T, Hayashi H,
　　Kawaguchi M, Akiyama K.
　　Stimulation of asymbiotic sporulation in arbuscular mycorrhizal fungi by fatty acids.
　　Nature Microbiology 2019, 4(10), 1654-1660. doi: 10.1038/s41564-019-0485-7. [Pubmed]

口頭発表

1．半田佳宏，行木信一
　　「真正細菌で保存されているYaeJタンパク質の機能解析」
　　平成20年度日本生化学学会関東支部例会，2008年6月
2．半田佳宏，稲穂紀幸，伊藤暁，行木信一
　　「ペプチジル-tRNA加水分解能をもつYaeJタンパク質による滞ったリボソームの新規解放機構の研究」
　　第12年日本RNA学会年会，東京，2010年7月
3.　半田佳宏，武田直也，川口正代司，斎藤勝晴
　　「マメ科植物とアーバスキュラー菌根菌の共生機構の解明」
　　第16回生命科学セミナー，群馬，2013年3月（招待講演）
4.　半田佳宏，山本航平，西出浩世，浅尾久世，重信秀治，川口正代司，内山郁夫，山田明義，斎藤勝晴
　　「Sphaerocreas pubescens と Endogone pisiformisのゲノム解析は陸上植物と真菌との共生の進化につ
　　　いて理解を深める」
　　日本菌学会第58回大会，石川，2014年6月
5.　半田佳宏，柴田朋子，山本航平，大井祥子，西出浩世，浅尾久世，山口勝司，重信秀治，西山智明，長谷部光泰，
　　内山郁夫，川口正代司，山田明義，斎藤勝晴
　　「Endogonales菌類のゲノム解析」
　　菌根研究会2014年度大会，柏，2014年11月
6.　半田佳宏
　　「環境DNA解析の基礎と生物技研の取り組み」
　　分子生物科学セミナー，群馬，2018年5月 （招待講演）[スライド]
7. 　半田佳宏, 中野江一郎
　　「環境DNA分析の普及に向けて」
　　半蔵門勉強会、東京、2018年9月 （招待講演？）[スライド]
8.　半田佳宏, 野口佳代子, 阿部洋子, 小野美奈子, 小暮裕幸, 清水拓海, 中野江一郎
　　「環境DNAメタバーコーディング法による昆虫相の解析～DNA配列データベースの充実に向けて～」
　　日本昆虫学会第78回大会, 愛知, 2018月9月　[スライド]

ポスター発表

1. 小暮裕幸，半田佳宏，井上裕介，行木信一
　　「新規ミトコンドリアタンパク質ICT1の機能解析」
　　第32回日本分子生物学学会年会，2009年12月
2. 樋川雄介，半田佳宏，伊藤暁，行木信一
　　「ミトコンドリアリボソームタンパク質ICT1の機能解析」
　　第12回日本RNA学会年会，2010年7月
3. 伊藤暁，半田佳宏，稲穂紀幸，行木信一
　　「滞ったリボソームの新規解放機構に関わるyaeJ遺伝子の転写調節機構解析」
　　第12回日本RNA学会年会，2010年7月
4. 出口敏彦，半田佳宏，行木信一
　　「酵母におけるミトコンドリアタンパク質ICT1の機能解析」
　　第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学学会大会，2010年12月
5. 伊藤暁，半田佳宏，稲穂紀幸，行木信一
　　「Anlysis of expression of the yaeJ operon from Escherichia coli」
　　第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学学会大会，2010年12月
6. Yoshihiro Handa, Yusuke Hikawa, Naoya Tochio, Hiroyuki Kogure, Makoto Inoue, Seizo Koshiba, Peter
　　Güntert, Yusuke Inoue, Takanori Kigawa, Shigeyuki Yokoyama, Nobukazu Nameki
　　「Solution structure of the catalytic domain of the mitochondrial protein ICT1 that is essential for cell 　
　　vitality.」
　　7th Asian symposium of Mitochondrial Research and Medicine and 10th Japanese Mitochondrial 　　
　　Research and Medicine, Fukuoka, December 2010
7. Yoshihiro Handa, Naoya Takeda, Masayoshi Kawaguchi, Katsuharu Saito
　　XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions, Kyoto, 2011.
8. 半田佳宏，武田直也，川口正代司，斎藤勝晴
　　「ミヤコグサにおける根粒と菌根のRNA-seq解析」
　　第22回植物微生物研究会，神戸，2012年9月
9. 半田佳宏，武田直也，川口正代司，斎藤勝晴
　　「次世代シークエンサーを用いた新奇菌根共生制御遺伝子の同定」
　　第54回日本植物生理学会年会，岡山，2013年3月
10. 半田佳宏，川口正代司，斎藤勝晴
　　「共生と生殖過程に関与する遺伝子の発現解析」
　　第55回日本植物生理学会年会，富山，2014年3月
11. 半田佳宏, 勝又啓史, 藤井渉, 高崎一人, 布藤聡, 中野江一郎
　　「真菌類を対象としたアンプリコン解析のための条件検討」
　　NGS現場の会第四回研究会，つくば，2015年7月
12. 半田佳宏, 勝又啓史, 中島章, 布藤聡, 松平崇弘
　「次世代シーケンサーを用いた生態調査と食性調査」
　　日本生態学会第63回全国大会，仙台，2016年3月
13. 半田佳宏, 内村康祐, 野口佳代子, 小野美奈子, 東春奈, 勝又啓史, 中野江一郎
　「環境DNAから特定の生物群を検出するプライマーの検討　～海洋生物と外来生物・海草を例に～」
　　日本生態学会第64回全国大会，東京，2017年3月
14. 半田佳宏, 野口佳代子, 黒田紀子, 中野江一郎
　「6つの生物分類群由来DNAを環境DNAからそれぞれ特異的に検出する」
　　日本生態学会第65回全国大会，札幌，2018年3月
15. 半田佳宏, 野口佳代子, 阿部洋子, 小野美奈子, 亀甲武志, 菅原和宏, 中野江一郎
　「環境DNA分析を用いたイワナとコイの遺伝的多様性解析」
　　第1回環境DNA学会東京大会, 東京, 2018月9月
16. 半田佳宏, 野口佳代子, 阿部洋子, 宮越しずく, 小野美奈子, 小暮裕幸, 清水拓海, 中野江一郎
　「環境DNA解析を用いた節足動物の多様性解析」
　　日本生態学会第66回全国大会，神戸，2019年3月
17. 半田佳宏, 関口 俊, 関 将史, 阿部洋子, 野口桂代子, 小野美奈子, 内野英一, 中野江一郎
　「底生動物ユニバーサルプライマーgBenthosのためのデータベース整備」
　　第2回環境DNA学会東京大会, 神戸, 2019月11月
18. 半田佳宏、伊知地 稔、山口 晴代、河地 正伸、中野江一郎
　「カビ臭産出藍藻類のゲノム解析」
　　第54回⽇本⽔環境学会年会、岩手、2020年3月 (コロナウイルスの影響により中止)

研究者登録サイト

• ResearchGate
• Google Scholar

受賞歴

・群馬大学工業会奨励賞 (2008.3.25)
・日本生化学会関東支部例会ポスター賞 (2008.6.21)