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SPAdes
バクテリア用アセンブラ
インストール方法
ここ
でダウンロードします。
使い方
2x250 paired-end readの場合
spades.py -k 21,33,55,77,99,127 --careful --pe1-1 lib1_forward_1.fastq --pe1-2 lib1_reverse_1.fastq
-o spades_output
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