1. BLASTをおこなう
nr もしくは ntを使って,BLASTを行いgi番号を得る。
2.gi番号をtaxonomy IDに変換する
この
サイトから,gi_taxid_prot.dmpをダウンロードする。
このデータは,giとtaxidの2列からなる。
UNIXコマンドを使って,giからtaxidに変換する。
3.taxonomy IDからtaxid lineageを得る
taxidを
このサイトを使って,lineageを取得する。full taxid lineageをチェック
4.Taxonomy IDから生物種を分類
例えば,
2759: Eukaryota 真核生物
33090: Viridiplantae 緑色植物亜界
4751: Funji 真菌類
より詳細な生物種の分類も可能です。