めっちゃ文字化けしていますが,「リンク先のファイルをダウンロード」して保存して頂ければ,きちんと表示されます。Macだけかもしれませんが。。。(どうやったら,文字化け直るんだろ・・・?)
fastq形式からfasta形式に変換する
ダウンロード
使い方
perl fastq2fasta.pl -i input.fastq -o output.fasta |
fasta形式の任意の領域を切り出す
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input.fastaの50から100塩基を抜き出す場合
perl fasta_length.pl -i input.fasta -l 50 -m 100 -o output.fasta |
fastq形式の任意の領域を切り出す
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input.fastqの50から100塩基を抜き出す場合
perl fastq_length.pl -i input.fasta -l 50 -m 100 -o output.fastq |
任意のfastaIDを元に配列を抜き出す
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input.fastaから任意のIDのリスト(list.txt)を元に配列を抜き出す。
perl fasta_selection.pl -i input.fasta -l list.txt |