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Bowtie2

超早く短い配列をゲノムDNAにマッピングする。

インストール方法

ここでインストールする


使い方

@ゲノムレファレンスのインデックスを作成する
 bowtie2-build genome.fasta genome.fasta


Aマッピングを行う
 bowtie2 [options]* -1 data_R1.fasta -2 data_R2.fasta > output.sam

-p core number

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