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大量なプライマーの設計


 多くの配列(fastaファイル)に対し,それぞれプライマーを設計することを想定しています。

インストール方法

ここでダウンロードします。

primer3/2.3.6/primer3-src-2.3.6.tar.gzをダウンロードします。

解凍後,srcディレクトリ内でmakeする。

すると,primer3_coreというファイルが出来ています。

このファイルを/user/local/binにリンクを貼っとくと便利です。

使い方


プライマーを設計する。
 primer3_core < example
※ファイル内のexampleは,Nが入っていてうまくいかない場合があります。

大量に設計する場合は便利ですが,数個であればwebインターフェイスを利用した方がいいでしょう。


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